目前我國環(huán)境治理主要運(yùn)用三個手段，即指標(biāo)控制、項(xiàng)目審批、價格補(bǔ)貼，與傳統(tǒng)計劃經(jīng)濟(jì)時期的管理方式非常相似。在市場化進(jìn)程中，政府的這三種經(jīng)濟(jì)管理手段都在進(jìn)行改革，環(huán)境監(jiān)管領(lǐng)域的改革相對滯后。

一是指標(biāo)控制?！笆晃濉币?guī)劃中首次制定了3個節(jié)能減排約束性指標(biāo)，“十二五”規(guī)劃增加到7個。這些年，節(jié)能環(huán)保部門把大量精力放在這幾個指標(biāo)的分解下達(dá)、檢查落實(shí)上。這里涉及到如何對待政府制定的指標(biāo)問題。從上世紀(jì)90年代開始，國家就對計劃體制進(jìn)行了大幅度改革。計劃指標(biāo)從原來的約束性指標(biāo)，總體上轉(zhuǎn)變?yōu)轭A(yù)測性、指導(dǎo)性指標(biāo)；新設(shè)的幾個節(jié)能環(huán)保指標(biāo)則堅(jiān)持了約束性，完不成就要對地方問責(zé)。計劃經(jīng)濟(jì)時期制定和下達(dá)指標(biāo)要經(jīng)過幾上幾下、綜合平衡；分解下達(dá)節(jié)能環(huán)保約束性指標(biāo)則主要靠公式，地方與中央討價還價的余地比較小。每個五年規(guī)劃中，節(jié)能環(huán)保約束性指標(biāo)剛下達(dá)時完成起來很難，但經(jīng)過努力都能完成。這種相關(guān)主管部門自己定指標(biāo)、自己下達(dá)、自己統(tǒng)計、自己考核，缺少第三方參與的指標(biāo)控制方式，是否客觀、公正、有效，還有待進(jìn)一步驗(yàn)證。

二是項(xiàng)目審批。環(huán)評報告審批、節(jié)能評估報告審批是各類建設(shè)項(xiàng)目的前置審批事項(xiàng)。對這兩個環(huán)節(jié)有關(guān)部門把關(guān)很“嚴(yán)”，企業(yè)投入與耗時較長。環(huán)評和節(jié)能評估一旦通過，實(shí)際執(zhí)行情況往往很難掌控，存在著“重前期審批、輕過程監(jiān)管”的問題。

三是價格補(bǔ)貼。為了將企業(yè)經(jīng)濟(jì)活動的外部成本內(nèi)部化，世界各國采取的措施都是“誰污染、誰治理”，或者“污染者付費(fèi)制度”。而我國使用價格補(bǔ)貼作為治理排放的經(jīng)濟(jì)手段，凡脫硫、脫硝的發(fā)電企業(yè)，國家上調(diào)上網(wǎng)電價和銷售電價，補(bǔ)貼其增加的成本，也就說“企業(yè)污染，消費(fèi)者付費(fèi)”。很多發(fā)電企業(yè)不按規(guī)定運(yùn)行脫硫、脫硝設(shè)施，電價補(bǔ)貼就會變成利潤留在企業(yè)。消費(fèi)者出了錢，實(shí)際減排效果卻未達(dá)預(yù)期。