排放權(quán)交易機(jī)制中一個(gè)非常重要的問題是如何根據(jù)所設(shè)定的排放總量目標(biāo)，為交易體系所覆蓋的每一個(gè)排放主體或排放源分配其可以使用的排放配額，即實(shí)現(xiàn)排放配額的初始分配，這是實(shí)施排放權(quán)交易機(jī)制的基礎(chǔ)。理論上講，當(dāng)交易成本大于零時(shí)，不同的產(chǎn)權(quán)界定會(huì)導(dǎo)致不同的資源配置效率。排放配額的初始配置，事關(guān)經(jīng)濟(jì)主體對(duì)排放空間這種生產(chǎn)要素的配置效率，將直接影響交易體系中各經(jīng)濟(jì)主體的成本和收益分布，是建立健全碳排放交易機(jī)制的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。建立碳排放權(quán)分配機(jī)制，需綜合考慮碳排放權(quán)的分配原則、分配指標(biāo)、分配方法、分配路徑等內(nèi)容。

碳排放權(quán)的分配原則首先包括公平原則與效率原則。國(guó)際層面上的碳排放空間分配，往往強(qiáng)調(diào)公平原則，也是全球氣候治理機(jī)制的基礎(chǔ)原則，但在一個(gè)主權(quán)國(guó)家內(nèi)部，出于經(jīng)濟(jì)發(fā)展的考慮，往往更受重視效率原則。公平原則是碳排放權(quán)初始分配的首要原則。碳排放分配的公平性既關(guān)系到人與人之間的公平關(guān)系，也關(guān)系到人與自然之間的和諧關(guān)系；既要求代內(nèi)公平，還要求代際公平。國(guó)際社會(huì)從不同角度對(duì)公平原則提出多種理解，比如，國(guó)家主權(quán)原則，這是根據(jù)現(xiàn)行國(guó)際法規(guī)定各國(guó)主權(quán)的平等性派生出的一種原則；還包括歷史責(zé)任原則、支付能力原則、基本需求原則與平等原則，這些原則分別從排放的歷史責(zé)任、支付能力、人發(fā)展的基本需求與人權(quán)等角度提出。發(fā)展中國(guó)家往往強(qiáng)調(diào)歷史責(zé)任原則和平等原則。近幾年我國(guó)針對(duì)碳排放權(quán)的初始分配開展了大量理論研究和實(shí)踐探索，在國(guó)內(nèi)排放配額分配時(shí)，充分考慮了全國(guó)各地經(jīng)濟(jì)發(fā)展不平衡、資源稟賦差異等情況，基于歷史責(zé)任原則、平等原則，乃至支付能力等原則，對(duì)碳交易政策實(shí)施的社會(huì)公平給予了充分考量。

效率原則是指碳排放權(quán)的分配應(yīng)致力于減少乃至消除對(duì)經(jīng)濟(jì)發(fā)展的負(fù)面影響。效率原則并非國(guó)際間碳排放空間分配的首要原則，通常作為公平原則的補(bǔ)充而存在，在一國(guó)之內(nèi)，效率原則受到的重視程度相對(duì)高一些。

碳排放權(quán)的分配還要考慮可行性原則。碳排放權(quán)的分配會(huì)受到各種主客觀條件制約，國(guó)家和省級(jí)碳交易主管部門制訂配額分配方案時(shí)，要充分考慮溫室氣體排放情況、經(jīng)濟(jì)水平、產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)、能源結(jié)構(gòu)、數(shù)據(jù)可獲得性等因素，尤其是要與重點(diǎn)排放單位進(jìn)行充分溝通，獲得排放企業(yè)的支持，以便順利推動(dòng)排放交易政策的執(zhí)行落實(shí)。

碳排放權(quán)的分配還應(yīng)遵循簡(jiǎn)明原則。一方面，盡量避免行政程序上的復(fù)雜性，使碳排放權(quán)分配方案操作起來(lái)要簡(jiǎn)單易行。另一方面，要不斷探索完善相關(guān)的核算方法，力求采用簡(jiǎn)單易行的分配指標(biāo)。

歷史責(zé)任的標(biāo)準(zhǔn)受到廣泛討論。溫室氣體在大氣中具有長(zhǎng)期滯留性，一個(gè)國(guó)家或者地區(qū)歷史排放量越大，承擔(dān)的減排責(zé)任就越大。體現(xiàn)歷史責(zé)任的重要指標(biāo)，包括一個(gè)國(guó)家或地區(qū)的碳排放總量和歷史累積排放總量，以及人均碳排放量和人均歷史累積排放量。

碳排放權(quán)初始分配方法大體分為無(wú)償分配和有償分配，其中有償分配又可分為公開拍賣和定價(jià)出售。

第一，無(wú)償分配。無(wú)償分配主要依據(jù)歷史排放水平，按一定方式，比如祖父制，確定其可無(wú)償獲得的排放配額數(shù)量。目前我國(guó)碳交易國(guó)家主管部門根據(jù)不同行業(yè)的具體情況，參考相關(guān)行業(yè)主管部門的意見，確定統(tǒng)一的配額免費(fèi)分配方法和標(biāo)準(zhǔn)。無(wú)償分配的優(yōu)點(diǎn)是不增加排放主體的成本，易于獲得排放主體的支持，利于在相對(duì)小的阻力下推進(jìn)政策的實(shí)施。無(wú)償分配也不涉及政府和排放主體之間的費(fèi)用轉(zhuǎn)移問題。無(wú)償分配的不足也是明顯的。排放配額的初始免費(fèi)分配在不自覺地維護(hù)能源密集型企業(yè)利益的同時(shí)，在一定程度上也損害了非能源密集型企業(yè)的利益。此外，如果初始配額分配得過多或不足，則不利于形成健康的碳市場(chǎng)供求關(guān)系，碳排放權(quán)價(jià)格的調(diào)節(jié)能力也有可能減弱。

第二，有償分配。有償分配大體包括公開拍賣和政府定價(jià)出售，這兩種方式都是從一級(jí)市場(chǎng)開始就實(shí)現(xiàn)碳排放空間的有償使用。碳排放權(quán)的公開拍賣是指利用市場(chǎng)機(jī)制實(shí)現(xiàn)碳排放配額在不同主體間的有效配置。從經(jīng)濟(jì)學(xué)角度看，基于市場(chǎng)機(jī)制調(diào)節(jié)的供需關(guān)系和價(jià)格水平最有效率，拍賣是實(shí)現(xiàn)最低減排成本的最佳途徑。但需注意的是，在拍賣過程中，如果部分地區(qū)拍賣，部分地區(qū)免費(fèi)分配，則可能出現(xiàn)競(jìng)爭(zhēng)扭曲，導(dǎo)致碳泄漏或滋生尋租，反而會(huì)額外增加排放權(quán)的支付費(fèi)用。定價(jià)出售是采用政府主導(dǎo)價(jià)格的方式，由政府統(tǒng)一規(guī)定排放配額碳在市場(chǎng)上的出售價(jià)格。這種方式在碳市場(chǎng)體系不健全、碳價(jià)格難以發(fā)現(xiàn)的情況下，可以作為一種碳定價(jià)的補(bǔ)充方式。隨著碳交易體系的不斷完善，政府定價(jià)要逐漸減弱，讓市場(chǎng)在決定碳的初始價(jià)格的過程中起決定性作用。

無(wú)償分配和有償分配不是不相容，二者在一定情況下可配合使用。我國(guó)《碳排放交易管理暫行辦法》規(guī)定，排放配額分配在初期以免費(fèi)分配為主，適時(shí)引入有償分配，并逐步提高有償分配的比例。同時(shí)還規(guī)定，國(guó)務(wù)院碳交易主管部門在排放配額總量中預(yù)留一定數(shù)量，用于有償分配、市場(chǎng)調(diào)節(jié)、重大項(xiàng)目建設(shè)等。有償分配所獲得的收益，用于促進(jìn)國(guó)家減碳以及相關(guān)的能力建設(shè)。

國(guó)際碳排放空間的分配，是直接分配給主權(quán)國(guó)家。在一國(guó)內(nèi)部，碳排放配額最終要分配落實(shí)到單個(gè)的排放主體。受管理成本以及信息不對(duì)稱的制約，在碳排放權(quán)分配的實(shí)踐中，往往不易由國(guó)家層面直接分配給排放主體，需要通過地方政府、行業(yè)協(xié)會(huì)或者企業(yè)等不同的媒介來(lái)共同完成碳排放配額的分配，這就形成了不完全相同的分配路徑，從目前碳排放交易的實(shí)踐來(lái)看，大體分為兩種路徑。

一是 “中央政府—地方政府—排放企業(yè)”分配路徑。該路徑也是當(dāng)前我國(guó)在實(shí)施碳排放交易時(shí)主要采取的排放配額分配路徑，依托我國(guó)固有的分級(jí)行政管理體制實(shí)行。在這條路徑中，中央政府對(duì)碳排放配額的初始分配擁有絕對(duì)管理監(jiān)督權(quán)限，除了由中央政府制定相關(guān)的標(biāo)準(zhǔn)外，還體現(xiàn)在由國(guó)務(wù)院碳交易主管部門確定各省、自治區(qū)和直轄市的排放配額總量和免費(fèi)分配的排放配額數(shù)量，同時(shí)省級(jí)碳交易主管部門確定的本行政區(qū)內(nèi)的重點(diǎn)排放單位名單還需上報(bào)國(guó)務(wù)院碳交易主管部門，國(guó)務(wù)院碳交易主管部門確認(rèn)后向社會(huì)公布。這種分配路徑在碳交易市場(chǎng)發(fā)展的初期，利于推動(dòng)全國(guó)碳交易市場(chǎng)的統(tǒng)一、規(guī)范發(fā)展。二是“中央政府—行業(yè)主管部門—排放企業(yè)”分配路徑。這條分配路徑更多是在某個(gè)行業(yè)內(nèi)部開展。在確定全國(guó)碳排放配額后，中央政府根據(jù)一定的標(biāo)準(zhǔn)，直接將排放配額分配給某個(gè)重點(diǎn)排放行業(yè)的主管部門，再經(jīng)由行業(yè)主管部門分配給排放企業(yè)。我國(guó)開展的“千家企業(yè)節(jié)能行動(dòng)”和“萬(wàn)家企業(yè)節(jié)能低碳行動(dòng)”都采取了類似的思路。與上面一種分配路徑相比，該路徑更多反映的是一種垂直路徑，事實(shí)上是中央政府將排放配額直接分配給排放企業(yè)。